Buod
Ang kwento ay itinakda sa malayong hinaharap. Nawasak ang lupa, at itinatag ng sangkatauhan ang mobile fort city Plantation. Ang mga piloto na ginawa sa loob ng Plantation ay nakatira sa Mistilteinn, na kilala rin bilang "birdcage." Ang mga bata ay nakatira doon na walang alam sa labas ng mundo o ang kalayaan ng kalangitan. Ang kanilang buhay ay binubuo ng pakikipaglaban upang maisakatuparan ang mga misyon. Ang kanilang mga kaaway ay misteryosong higanteng mga form ng buhay na kilala bilang Kyōryū, at ang mga bata na pilot robot na tinawag na Franxx upang harapin laban sa kanila. Para sa mga bata, ang pagsakay sa Franxx ay nagpapatunay ng kanilang pagkakaroon.
Ang isang batang lalaki na nagngangalang Hiro ay tinawag na Code: 016, at siya ay dating kilala bilang isang prodigy. Gayunpaman, siya ay nahuli, at ang kanyang pag-iral ay tila hindi kinakailangan. Ang hindi pag-piloto ng isang Franxx ay kapareho ng pagtigil sa pagkakaroon. Isang araw, isang misteryosong batang babae na kilala bilang "Zero Two" ang humarap sa kanya. Lumabas mula sa kanyang ulo ang dalawang sungay.