Buod
Sinusunod ng manga ang kwento ng 16-taong-gulang na si Mana sa isang pakikipagsapalaran sa pamamagitan ng Panahon ng Aquarian.
Isang labing-anim na taong gulang na batang babae, si Mana ay bumalik sa kanyang bayan at muling nakasama ang kanyang kaibigan sa pagkabata matapos na nawala sa loob ng pitong taon. Ngunit ang kaibigan niya, si Kaname, ay tila nagbago din habang sila ay magkalayo.
Ang muling paglitaw ni Mana ay agad na nagtatakda ng isang serye ng mga kaganapan na binago ang buhay ni Kaname at ng kanyang matalik na kaibigan, si Naoya. Ang mga kamag-aral na sina Isshin at Tsukasa, pati na rin ang kanilang guro na si Tomonori, ay nahahalina din.
Di-nagtagal, natuklasan nilang lahat na mayroon silang bahagi sa "Panahon ng Aquarian" - isang giyera na lihim na nagngangalit sa loob ng libu-libong taon.
Ngayon ang hinaharap ng mundo ay nakasalalay sa isang batang babae at kanyang kapalaran.