UC 0097, isang taon pagkatapos ng pagbubukas ng “Laplace's Box”.
Sa kabila ng paghahayag ng Universal Century Charter na kinikilala ang pagkakaroon at mga karapatan ng Newtypes, ang balangkas ng mundo ay hindi lubos na binago.
Ang salungatan sa paglaon ay tinawag na "Laplace Insidente" ay naisip na natapos sa pagbagsak ng mga labi ng Neo Zeon na kilala bilang Sleeves. Sa huling labanan nito, ang dalawang buong psycho-frame na mobile suit ay nagpakita ng lakas na lampas sa pag-unawa ng tao. Ang puting unicorn at ang itim na leon ay tinatakan upang alisin ang panganib na ito mula sa kamalayan ng mga tao, at sila ay dapat na ngayong nakalimutan.
Gayunpaman, ang RX-0 Unicorn Gundam 03, na nawala ng dalawang taon nang mas maaga, ngayon ay malapit nang ipakita ang sarili nito sa Earth Sphere nang isang beses. Isang ginintuang phoenix ... pinangalanan Phenex.
