Si Marie ay nakulong sa isang kakila-kilabot na sitwasyon. Patuloy siyang pinahihirapan ng kanyang mga kamag-aral at regular na ginugulo ng kanyang guro. Kahit saan pa man lumingon, nahahanap niya ang sarili na humihingi ng tulong sa higit sa likas mula sa isa sa pitong demonyo ng pitong misteryo ng kanyang paaralan. Ang hinahangad lang niya ay ang pagkamatay ng kanyang malupit na mga kamag-aral at guro. Gaano kalayo kalayo ang handa niyang puntahan upang makamit ang mga pagpatay na magpapalaya sa kanya mula sa kanyang nabubuhay na impiyerno?
Ang Higanbana no Saku Yoru ni ay nagaganap sa isang hindi pinangalanang setting ng paaralan at binubuo ng maraming maiikling kwento, na bawat isa ay sinabi mula sa pananaw ng isang mag-aaral o kawani mula sa paaralan. Ang mga kuwentong ito ay nagtatampok ng pananakot bilang isang pangunahing labis na tema, dahil ang kalaban ng bawat kwento ay inilalarawan bilang isang biktima ng pananakot o isang pambu-bully sa kanilang sarili. Ang Higanbana ay umiikot sa isang serye ng mga alamat sa lunsod na sanhi ng mga di-likas na nilalang na tinatawag na y? Kai, na ang bawat isa ay nag-aangkin ng pagmamay-ari ng isang partikular na "misteryo" at pinapatay ang sinumang nagtatangkang siyasatin ito. Mayroong kabuuang pitong "mga misteryo" sa pagsisimula ng serye, na may maraming y? Kai na nakikipaglaban sa bawat isa sa isang nagpapatuloy na digmaan ng karerahan para sa pagmamay-ari ng mga hiwagang ito, na ipinagkaloob sa pitong y? Kai na lumitaw na nagwagi sa tunggalian . Ang mga kalaban ng kwento ay nakikipag-ugnay sa hindi bababa sa isa sa residente ng paaralan na y? Kai, na pinipilit ang mga kalaban na harapin ang mga kahihinatnan ng kanilang mga aksyon tungkol sa pananakot.
