Buod
Ang AD2072, mga nakakatakot na halimaw, na kilala bilang "Aragami" (Bewildered Gods), ay lumitaw sa Earth at nagsimulang manghuli sa mga tao. Ang populasyon ng tao ay bumaba sa 1/100 sa loob lamang ng ilang taon, at ang mundo ay malapit nang magtapos. Gayunpaman, mayroong isang pangkat ng mga tao na nakikipaglaban sa mga mabangis na halimaw na ito, na gumagamit ng sandatang biological, na kilala bilang "Jinki" (God Device). Ang mga taong ito ay tinawag bilang "GE" (God Eaters). Ang manga na ito ay umiikot sa isa sa mga God Eater, Silva, at ang kanyang pananakop upang ibalik ang pag-asa ng sangkatauhan ...